Τα τελωνεία που κλείνουν βρίσκονται κυρίως κοντά στα σύνορα της χώρας και σε ακριτικά νησιά όπως στην Χάλκη, στην Αστυπάλαια, στην Ηγουμενίτσα (Σαγιάδα, Αμπελώνας) και στη Σιάτιστα Καστοριάς.
Τα υπόλοιπα τελωνεία που κλείνουν είναι: Οι ελεγκτικές υπηρεσίες τελωνείων Πάτρας και τα τελωνεία Μεσολογγίου, Αμφιλοχίας, Ωρωπού, Κοιλάδας (Ναύπλιο), Τρίπολης, Λεωνιδίου, Θηβών, Τήλου, Κάσου Σαμοθράκης, Αλιβερίου, Κύμης, Σκύρου, Καρύστου, Κατακώλου, Τυμπακίου, Νέας Μηχανιώνας, Πύργου, Ελευθερών (Καβάλας), Θάσου, Καρδίτσας, Παξών, Ιθάκης, Σάμης, Αγίων Θεοδώρων και Σικυώνος (Κόρινθος).